Az intézetet 1996-ban a Fórum Alapítvány és a Katedra Alapítvány alapította Dunaszerdahelyen. Jelenleg Somorján és Komáromban működik. Célja a Szlovákiában élő nemzeti kisebbségek szakszerű kutatása, kultúrájuk, írott és egyéb emlékeik dokumentálása. Nonprofit szervezetként köz- és szolgáltató intézményként működik.

A Fórum Kisebbségkutató Intézet 2002-ben Somorján építette ki központját és székházát. Az intézet önálló kiadó, publikációit maga jelenteti meg és terjeszti. A publikációk megrendelhetők az intézet internetes Könyvesboltjában.

2006 óta Nemzeti jelentőségű intézmény.

Alapítója (2009) és tagja a Szlovákiai Magyarok Kerekasztalának.

2013-tól lebonyolító intézménye az MTA által létrehozott Szlovákiai Magyar Akadémiai Tanácsnak.